甘肅省敦煌種業集團股份有限公司是為搭建融資平臺，加快區內優勢產業發展而整合、重組酒泉境內的國有種子公司和棉花公司所設立的股份制企業，公司于1998年底經省人民政府批準設立，2003年12月29日公開發行7500萬A股股票，2004年1月15日在上海證券交易所掛牌上市。